En 2012 y 2018, en el Proyecto Alternativo de Nación, el entonces candidato Andrés Manuel López Obrador se comprometió a fortalecer la autonomía y las atribuciones del Instituto Federal de Acceso de la Información y Protección de Datos (IFAI, ahora INAI), así como respetar la autonomía de los organismos autónomos. Más de 10 años después, una iniciativa impulsada por él terminó por extinguir a siete organismos autónomos. 

Durante su segunda campaña presidencial por el Partido de la Revolución Demócratica (PRD), en 2012, el ahora expresidente enfatizó que en su mandato buscaría "dotar de plena autonomía e independencia al Instituto Federal de Acceso a la Información Pública y a la Auditoría Superior de la Federación, para profesionalizar sus tareas fiscalizadoras y evaluadora, y para someterlas a un estricto régimen de rendición de cuentas".

Además, prometió que iba a reformar la Ley Federal de Transparencia para constituir formalmente al IFAI como organismo público autónomo, que la designación de los comisionados fuera por medio del voto calificado en la Cámara de Diputados para el nombramiento de los comisionados, y que se incluyera a los partidos políticos y al sector privado como sujetos obligados. 

En el Proyecto Alternativo de Nación del 2012 participaron la presidenta Claudia Sheinbaum; el secretario de Hacienda, Rogelio Ramírez de la O; la expresidenta del Consejo Nacional de Morena, Bertha Luján; el ahora coordinador de Asesores de la Presidencia, Jesús Ramírez Cuevas; y la periodista y escritora Elena Poniatowska. 

Seis años después, en su proyecto para el 2018-2024, el entonces candidato nuevamente reafirmó su promesa y se comprometió a que "los proyectos gubernamentales habrán de respetar la separación de poderes y la autonomía de los organismos autónomos del Estado y garantizar la certidumbre jurídica de todos los contratos vigentes, particularmente los derivados de las llamadas 'reformas estructurales'". 

Sin embargo, no hizo mención explícita de propuestas a favor o en contra del INAI como sí lo había hecho en su Proyecto Alternativo de Nación del 2012.

El 21 de noviembre del 2024, el pleno de la Cámara de Diputados aprobó en lo general y lo particular la reforma que desaparece siete organismos autónomos, entre ellos el INAI.

La aprobación de esta reforma a diversos artículos de la Constitución se dio por 332 votos a favor de Morena, PT y PVEM, y 119 contra del PAN, PRI y Movimiento Ciudadano. La minuta fue turnada al Senado de la República para su análisis.