El gobierno estadounidense planeó siete operaciones para capturar al narcotraficante Joaquín "El Chapo" Guzmán entre 2009 y 2016, pero enfrentó obstáculos por la corrupción en México, de acuerdo con el libro El Jefe de Alan Feuer, periodista del New York Times. 

Feuer indica que el FBI, la CIA y la DEA, todas agencias de Estados Unidos, planearon intentos de capturas en Los Cabos, Tepic, Culiacán y La Paz, así como los arrestos en el Hotel Miramar en 2014 y en Los Mochis en 2016.

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De acuerdo con el libro, las agencias estadounidenses no tenían problemas para localizar a Guzmán puesto que "las comunicaciones eran tan esenciales para su operación que siempre había inteligencia que indicara su paradero".

La parte más difícil, agrega, era "decidir a quién confiar su detención entre las agencias policiacas locales" por "la corrupción en el gobierno" mexicano. 

La Policía Federal fue la primera que las agencias estadounidenses descartaron debido al legado que dejó Genaro García Luna. Luego consideraron al Ejército, pero la DEA tampoco confiaba en éste porque también estaba corrompido por el narcotráfico, por lo que finalmente recurrieron a los marinos, a quienes calificaron como "motivados, hábiles y absolutamente intrépidos".

El periodista del New York Times menciona una operación realizada entre el 2013 y 2014, cuando ubicaron a "El Chapo" en el sur de Baja California, y dice que las agencias estadounidenses evitaron informar al gobierno mexicano del hallazgo. 

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También explica que la operación, llamada "Duck Dynasty", puso a los marinos "en conflicto con sus propios líderes civiles", pero que aún así aceptaron. 

No fue hasta que realizaron el operativo "Tercer Strike", que derivó en la detención de Guzmán en 2016, que el CISEN estuvo involucrado en el proceso. 

De acuerdo con Feuer, las agencias estadounidenses vieron que el CISEN tenía un "arma secreta" (el programa de espionaje Pegasus) gracias a la cual pudieron trazar un mapa de la red de Guzmán y finalmente capturar al narcotraficante.